南京大学休学办理流程如下：
1. 学生首先需要向所在学院提交休学申请，并注明休学原因。
2. 学院将对休学申请进行审核，并在一定的时间内告知学生是否批准休学。
3. 如果学院批准了休学申请，学生需要向所在学校提交休学证明，证明学生已经向所在学院提交了休学申请。
4. 学校将对休学证明进行审核，并在一定的时间内给学生发放休学通知单。
5. 学生需要按照休学通知单上的要求办理离校手续，包括离校前的课程安排、宿舍安排、医疗保险等。
6. 离校后，学生需要积极配合学校安排，按时返校办理相关课程和手续。
南京大学休学办理流程较为复杂，学生需要积极配合学院和学校的相关安排，确保休学手续的顺利办理。同时，学生还需要遵守学校的相关规定，以确保自己的身心健康和学业的顺利完成。
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